Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc4Q3TR08 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc4Q3TR08 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms