Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gtf3c3Q3TMP1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms