Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR3

Nlrp4c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4cQ3TKR3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrp4cQ3TKR3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrp4cQ3TKR3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms