Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIU4

Pde12, 2',5'-phosphodiesterase 12, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde12Q3TIU4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pde12Q3TIU4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pde12Q3TIU4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pde12Q3TIU4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pde12Q3TIU4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde12Q3TIU4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde12Q3TIU4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde12Q3TIU4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde12Q3TIU4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde12Q3TIU4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde12Q3TIU4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde12Q3TIU4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde12Q3TIU4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde12Q3TIU4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde12Q3TIU4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde12Q3TIU4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde12Q3TIU4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde12Q3TIU4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde12Q3TIU4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pde12Q3TIU4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde12Q3TIU4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde12Q3TIU4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde12Q3TIU4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde12Q3TIU4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde12Q3TIU4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde12Q3TIU4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pde12Q3TIU4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde12Q3TIU4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde12Q3TIU4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde12Q3TIU4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pde12Q3TIU4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms