Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem104Q3TB48 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem104Q3TB48 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms