Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jmjd8Q3TA59 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms