Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Treml4Q3LRV9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms