Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trpm1Q2TV84 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trpm1Q2TV84 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trpm1Q2TV84 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trpm1Q2TV84 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trpm1Q2TV84 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trpm1Q2TV84 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Trpm1Q2TV84 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trpm1Q2TV84 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trpm1Q2TV84 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trpm1Q2TV84 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trpm1Q2TV84 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trpm1Q2TV84 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trpm1Q2TV84 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trpm1Q2TV84 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trpm1Q2TV84 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trpm1Q2TV84 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trpm1Q2TV84 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trpm1Q2TV84 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Trpm1Q2TV84 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Trpm1Q2TV84 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Trpm1Q2TV84 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Trpm1Q2TV84 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trpm1Q2TV84 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Trpm1Q2TV84 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trpm1Q2TV84 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trpm1Q2TV84 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trpm1Q2TV84 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trpm1Q2TV84 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Trpm1Q2TV84 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trpm1Q2TV84 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trpm1Q2TV84 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trpm1Q2TV84 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trpm1Q2TV84 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trpm1Q2TV84 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Trpm1Q2TV84 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trpm1Q2TV84 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trpm1Q2TV84 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trpm1Q2TV84 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trpm1Q2TV84 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trpm1Q2TV84 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trpm1Q2TV84 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trpm1Q2TV84 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trpm1Q2TV84 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trpm1Q2TV84 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trpm1Q2TV84 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trpm1Q2TV84 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trpm1Q2TV84 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trpm1Q2TV84 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trpm1Q2TV84 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trpm1Q2TV84 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trpm1Q2TV84 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trpm1Q2TV84 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trpm1Q2TV84 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trpm1Q2TV84 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trpm1Q2TV84 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trpm1Q2TV84 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trpm1Q2TV84 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trpm1Q2TV84 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trpm1Q2TV84 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trpm1Q2TV84 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms