Protein–RNA interactions for Protein: Q2PFD7

Psd3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psd3Q2PFD7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psd3Q2PFD7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psd3Q2PFD7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psd3Q2PFD7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psd3Q2PFD7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psd3Q2PFD7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Psd3Q2PFD7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Psd3Q2PFD7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psd3Q2PFD7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psd3Q2PFD7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Psd3Q2PFD7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psd3Q2PFD7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psd3Q2PFD7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psd3Q2PFD7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psd3Q2PFD7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psd3Q2PFD7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Psd3Q2PFD7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Psd3Q2PFD7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psd3Q2PFD7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psd3Q2PFD7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psd3Q2PFD7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psd3Q2PFD7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Psd3Q2PFD7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Psd3Q2PFD7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Psd3Q2PFD7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psd3Q2PFD7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psd3Q2PFD7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms