Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nlrp1aQ2LKU9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrp1aQ2LKU9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms