Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm1123Q1RME4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm1123Q1RME4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms