Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Myo3bQ1EG27 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Myo3bQ1EG27 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms