Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam171bQ14CH0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Fam171bQ14CH0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam171bQ14CH0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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