Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rpusd2Q149F1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
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Rpusd2Q149F1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpusd2Q149F1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms