Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Cpne7Q0VE82 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cpne7Q0VE82 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpne7Q0VE82 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms