Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL1

Tigd2, Tigger transposable element-derived protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd2Q0VBL1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tigd2Q0VBL1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tigd2Q0VBL1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tigd2Q0VBL1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tigd2Q0VBL1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tigd2Q0VBL1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tigd2Q0VBL1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tigd2Q0VBL1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tigd2Q0VBL1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tigd2Q0VBL1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tigd2Q0VBL1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tigd2Q0VBL1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tigd2Q0VBL1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tigd2Q0VBL1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tigd2Q0VBL1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tigd2Q0VBL1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tigd2Q0VBL1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tigd2Q0VBL1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms