Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ubxn2bQ0KL01 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ubxn2bQ0KL01 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ubxn2bQ0KL01 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ubxn2bQ0KL01 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ubxn2bQ0KL01 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ubxn2bQ0KL01 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ubxn2bQ0KL01 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ubxn2bQ0KL01 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ubxn2bQ0KL01 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ubxn2bQ0KL01 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ubxn2bQ0KL01 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ubxn2bQ0KL01 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ubxn2bQ0KL01 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ubxn2bQ0KL01 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ubxn2bQ0KL01 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ubxn2bQ0KL01 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ubxn2bQ0KL01 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ubxn2bQ0KL01 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ubxn2bQ0KL01 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ubxn2bQ0KL01 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ubxn2bQ0KL01 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn2bQ0KL01 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn2bQ0KL01 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn2bQ0KL01 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn2bQ0KL01 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn2bQ0KL01 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn2bQ0KL01 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn2bQ0KL01 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ubxn2bQ0KL01 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ubxn2bQ0KL01 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ubxn2bQ0KL01 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ubxn2bQ0KL01 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ubxn2bQ0KL01 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ubxn2bQ0KL01 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ubxn2bQ0KL01 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ubxn2bQ0KL01 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ubxn2bQ0KL01 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ubxn2bQ0KL01 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ubxn2bQ0KL01 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ubxn2bQ0KL01 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms