Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ttc21bQ0HA38 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Ttc21bQ0HA38 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ttc21bQ0HA38 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ttc21bQ0HA38 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ttc21bQ0HA38 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ttc21bQ0HA38 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ttc21bQ0HA38 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ttc21bQ0HA38 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ttc21bQ0HA38 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ttc21bQ0HA38 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ttc21bQ0HA38 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ttc21bQ0HA38 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ttc21bQ0HA38 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ttc21bQ0HA38 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ttc21bQ0HA38 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ttc21bQ0HA38 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ttc21bQ0HA38 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ttc21bQ0HA38 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ttc21bQ0HA38 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Ttc21bQ0HA38 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ttc21bQ0HA38 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ttc21bQ0HA38 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ttc21bQ0HA38 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ttc21bQ0HA38 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ttc21bQ0HA38 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ttc21bQ0HA38 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ttc21bQ0HA38 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ttc21bQ0HA38 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Ttc21bQ0HA38 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ttc21bQ0HA38 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ttc21bQ0HA38 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ttc21bQ0HA38 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ttc21bQ0HA38 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ttc21bQ0HA38 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ttc21bQ0HA38 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms