Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Slc7a1Q09143 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc7a1Q09143 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms