Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q08AU9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q08AU9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q08AU9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q08AU9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q08AU9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q08AU9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q08AU9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q08AU9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q08AU9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q08AU9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q08AU9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q08AU9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q08AU9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q08AU9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q08AU9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q08AU9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q08AU9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q08AU9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q08AU9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q08AU9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q08AU9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q08AU9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q08AU9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q08AU9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q08AU9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q08AU9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q08AU9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q08AU9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q08AU9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q08AU9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q08AU9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q08AU9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q08AU9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q08AU9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q08AU9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q08AU9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q08AU9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q08AU9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q08AU9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q08AU9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q08AU9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q08AU9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q08AU9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q08AU9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q08AU9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q08AU9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q08AU9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q08AU9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q08AU9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q08AU9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q08AU9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q08AU9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q08AU9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q08AU9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q08AU9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q08AU9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q08AU9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q08AU9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q08AU9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q08AU9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q08AU9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q08AU9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q08AU9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q08AU9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q08AU9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q08AU9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q08AU9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q08AU9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q08AU9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q08AU9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q08AU9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q08AU9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q08AU9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q08AU9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q08AU9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q08AU9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q08AU9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q08AU9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q08AU9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q08AU9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q08AU9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q08AU9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q08AU9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q08AU9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q08AU9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q08AU9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q08AU9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q08AU9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q08AU9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q08AU9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q08AU9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q08AU9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q08AU9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q08AU9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q08AU9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q08AU9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q08AU9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q08AU9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q08AU9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms