Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gata4Q08369 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gata4Q08369 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gata4Q08369 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms