Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Col9a2Q07643 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col9a2Q07643 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Col9a2Q07643 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms