Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NrepQ07475 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NrepQ07475 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NrepQ07475 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NrepQ07475 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NrepQ07475 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NrepQ07475 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NrepQ07475 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NrepQ07475 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NrepQ07475 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NrepQ07475 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NrepQ07475 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NrepQ07475 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NrepQ07475 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NrepQ07475 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NrepQ07475 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NrepQ07475 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NrepQ07475 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NrepQ07475 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NrepQ07475 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NrepQ07475 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NrepQ07475 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NrepQ07475 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NrepQ07475 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NrepQ07475 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NrepQ07475 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NrepQ07475 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NrepQ07475 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NrepQ07475 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NrepQ07475 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NrepQ07475 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NrepQ07475 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NrepQ07475 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NrepQ07475 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NrepQ07475 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NrepQ07475 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NrepQ07475 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NrepQ07475 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NrepQ07475 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NrepQ07475 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NrepQ07475 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NrepQ07475 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NrepQ07475 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NrepQ07475 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NrepQ07475 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NrepQ07475 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NrepQ07475 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NrepQ07475 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NrepQ07475 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NrepQ07475 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NrepQ07475 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NrepQ07475 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NrepQ07475 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms