Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cntn3Q07409 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cntn3Q07409 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cntn3Q07409 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms