Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nfe2Q07279 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Nfe2Q07279 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nfe2Q07279 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nfe2Q07279 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nfe2Q07279 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nfe2Q07279 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nfe2Q07279 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nfe2Q07279 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nfe2Q07279 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms