Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gdf3Q07104 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gdf3Q07104 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms