Protein–RNA interactions for Protein: Q06890

Clu, Clusterin, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluQ06890 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CluQ06890 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CluQ06890 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CluQ06890 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CluQ06890 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CluQ06890 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CluQ06890 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CluQ06890 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CluQ06890 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CluQ06890 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CluQ06890 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CluQ06890 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CluQ06890 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CluQ06890 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CluQ06890 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CluQ06890 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CluQ06890 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CluQ06890 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CluQ06890 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CluQ06890 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CluQ06890 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CluQ06890 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CluQ06890 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CluQ06890 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CluQ06890 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CluQ06890 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CluQ06890 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CluQ06890 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CluQ06890 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CluQ06890 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CluQ06890 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CluQ06890 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CluQ06890 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CluQ06890 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CluQ06890 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CluQ06890 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CluQ06890 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CluQ06890 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CluQ06890 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CluQ06890 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CluQ06890 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CluQ06890 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CluQ06890 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CluQ06890 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CluQ06890 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CluQ06890 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CluQ06890 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CluQ06890 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CluQ06890 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CluQ06890 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CluQ06890 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CluQ06890 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CluQ06890 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CluQ06890 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CluQ06890 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CluQ06890 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CluQ06890 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CluQ06890 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CluQ06890 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CluQ06890 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CluQ06890 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CluQ06890 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CluQ06890 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CluQ06890 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CluQ06890 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CluQ06890 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CluQ06890 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CluQ06890 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CluQ06890 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CluQ06890 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CluQ06890 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CluQ06890 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CluQ06890 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CluQ06890 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CluQ06890 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CluQ06890 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CluQ06890 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CluQ06890 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CluQ06890 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CluQ06890 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CluQ06890 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CluQ06890 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CluQ06890 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CluQ06890 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CluQ06890 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CluQ06890 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CluQ06890 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CluQ06890 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CluQ06890 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CluQ06890 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CluQ06890 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CluQ06890 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CluQ06890 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CluQ06890 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CluQ06890 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CluQ06890 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CluQ06890 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CluQ06890 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CluQ06890 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CluQ06890 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms