Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atf4Q06507 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atf4Q06507 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms