Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nf1Q04690 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nf1Q04690 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms