Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cxcr5Q04683 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cxcr5Q04683 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms