Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scg2Q03517 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scg2Q03517 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms