Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tff2Q03404 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tff2Q03404 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tff2Q03404 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms