Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crisp3Q03402 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Crisp3Q03402 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms