Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cacna1sQ02789 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cacna1sQ02789 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cacna1sQ02789 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms