Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NfiaQ02780 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NfiaQ02780 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms