Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax5Q02650 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax5Q02650 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax5Q02650 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax5Q02650 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax5Q02650 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax5Q02650 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax5Q02650 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax5Q02650 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax5Q02650 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax5Q02650 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax5Q02650 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax5Q02650 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pax5Q02650 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax5Q02650 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax5Q02650 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax5Q02650 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax5Q02650 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax5Q02650 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax5Q02650 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax5Q02650 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax5Q02650 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax5Q02650 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pax5Q02650 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax5Q02650 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax5Q02650 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax5Q02650 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax5Q02650 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax5Q02650 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax5Q02650 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax5Q02650 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pax5Q02650 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pax5Q02650 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pax5Q02650 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax5Q02650 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms