Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Snai1Q02085 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snai1Q02085 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Snai1Q02085 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms