Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ascl1Q02067 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ascl1Q02067 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms