Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ly9Q01965 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ly9Q01965 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ly9Q01965 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms