Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HmgcrQ01237 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HmgcrQ01237 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HmgcrQ01237 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms