Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa1Q00623 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Apoa1Q00623 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Apoa1Q00623 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms