Protein–RNA interactions for Protein: Q00560

Il6st, Interleukin-6 receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6stQ00560 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Il6stQ00560 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Il6stQ00560 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Il6stQ00560 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms