Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Stx2Q00262 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms