Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gfra1P97785 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gfra1P97785 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms