Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Nbr1P97432 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms