Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nkx2-3P97334 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nkx2-3P97334 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms