Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gbx1P82976 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbx1P82976 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gbx1P82976 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms