Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nucb2P81117 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nucb2P81117 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms