Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otx1P80205 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otx1P80205 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otx1P80205 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otx1P80205 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otx1P80205 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otx1P80205 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otx1P80205 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otx1P80205 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otx1P80205 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otx1P80205 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms