Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf3P70671 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irf3P70671 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irf3P70671 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Irf3P70671 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Irf3P70671 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irf3P70671 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irf3P70671 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Irf3P70671 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Irf3P70671 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Irf3P70671 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irf3P70671 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irf3P70671 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Irf3P70671 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irf3P70671 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irf3P70671 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irf3P70671 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irf3P70671 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irf3P70671 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irf3P70671 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irf3P70671 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irf3P70671 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irf3P70671 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irf3P70671 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Irf3P70671 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Irf3P70671 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irf3P70671 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Irf3P70671 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Irf3P70671 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irf3P70671 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irf3P70671 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Irf3P70671 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irf3P70671 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irf3P70671 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irf3P70671 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irf3P70671 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Irf3P70671 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irf3P70671 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irf3P70671 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Irf3P70671 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Irf3P70671 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irf3P70671 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irf3P70671 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Irf3P70671 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irf3P70671 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Irf3P70671 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irf3P70671 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irf3P70671 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irf3P70671 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irf3P70671 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irf3P70671 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irf3P70671 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Irf3P70671 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irf3P70671 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irf3P70671 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Irf3P70671 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irf3P70671 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irf3P70671 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Irf3P70671 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irf3P70671 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irf3P70671 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Irf3P70671 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Irf3P70671 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irf3P70671 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Irf3P70671 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Irf3P70671 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Irf3P70671 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irf3P70671 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf3P70671 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf3P70671 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf3P70671 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf3P70671 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf3P70671 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf3P70671 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf3P70671 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf3P70671 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irf3P70671 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irf3P70671 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms